На промышленных плантациях наиболее рационально размещать растения на расстоянии между рядами 3–4 м, в рядах — 2,5–3 м. При этом учитывают не только требования растений, но и условия механизированной обработки междурядий.
На приусадебных участках растения высаживают через 2 м. Ямы для посадки делают шириной 60 см, глубиной 40 см и в каждую насыпают по ведру перегноя или торфонавозного компоста. Корни обмакивают в болтушку, приготовленную из глины, коровяка и воды. Сажать растения удобнее вдвоем, когда один человек насыпает в яму перегной или торфонавозный компост, смешанный с верхним слоем почвы, а другой опускает в яму саженец, расправляя корни. После засыпки корней почву плотно утаптывают.
Сеянцы черноплодной рябины не следует сажать глубже, чем они росли в питомнике, так как при этом образуется много корневой поросли. После посадки насаждения поливают из расчета ведро воды на два растения. На следующий год весной саженцы обрезают, оставляя пеньки 15–20 см. В первые пять-шесть лет почву между растениями можно использовать для возделывания картофеля, земляники и других культур. Под каждую культуру следует вносить органические и минеральные удобрения, предусмотренные агротехникой данной культуры. После того как кусты разрастутся, почва содержится под черным паром.
Черноплодная рябина введена в культуру сравнительно недавно, поэтому еще не разработана научно обоснованная система удобрения применительно к различным почвенным разностям. Внешним признаком нормального состояния растений является наличие ежегодного прироста длиной не менее 20 см. Чтобы его иметь, необходимо обеспечивать растение питательными веществами. Органические удобрения в виде навоза или торфонавозного компоста вносят один раз в два года в дозе 20–30 кг на куст. Используют также навозную жижу, разведенную водой 1:3. Азотные удобрения рекомендуется давать ежегодно по таломерзлой почве в дозе 20 г на 1 м2. Фосфорные и калийные — осенью через один-два года соответственно по 30 и 15–20 г на 1 м2. После цветения или в начале роста плодов хороший результат дает некорневая подкормка мочевиной из расчета 20–30 г на 10 л воды. После внесения удобрений почву под кустами перекапывают. В период вегетации проводят одно-два мотыжения.
Куст черноплодной рябины из-за большой побегопроизводительной и побеговосстановительной способности чрезмерно загущается. К семилетнему возрасту его основание имеет около 1 м в поперечнике и не менее 50 стволов. В длину ствол растет до 8 лет. Однако с возрастом поступательный рост затухает. Ветвление начинается со 2-го года, и в каждый последующий год количество обрастающих веточек увеличивается. Это сильно загущает куст и приводит к отмиранию плодовой древесины.
Основное, наиболее качественное плодоношение происходит на однолетних ветвях, то есть на прошлогоднем приросте. Поэтому необходимо создавать благоприятные условия для роста однолетних побегов. Ветви 7—8-летнего возраста дают ежегодный, но очень слабый прирост. И хотя на их долю приходится третья часть урожая, качество плодов резко ухудшается. Поэтому их целесообразно вырезать. Правильно сформированный куст должен иметь 50–70 ветвей (стволов) различного возраста. После того как их количество будет доведено до нормы, формирование куста заключается в ежегодном удалении наименее продуктивных стареющих ветвей и введении в состав куста пяти-шести прикорневых побегов. Кроме удаления старых ветвей прореживают и молодые поросли, оставляя лишь самые сильные, равномерно расположенные побеги. Побеги вырезают почти у самой земли, чтобы уменьшить образование отпрысков.
В условиях Северо-Запада старение основных ветвей у черноплодной рябины происходит медленнее и они могут сохранять высокую продуктивность до 13 лет. Чтобы продлить жизнь насаждений при высоком уровне урожайности, делают омолаживающую обрезку. На кафедре плодоводства ЛСХИ 10 лет изучали принципиально новую систему обрезки черноплодной рябины по типу снижения кроны. Лучшей оказалась обрезка на 1/2 высоты куста, то есть на 1 м от поверхности почвы. Это увеличило количество смешанных, наиболее продуктивных побегов и улучшило качество ягод, которые стали значительно крупнее, чем на контрольных кустах. Отмечено также, что омолаживающая обрезка (один раз в 3–5 лет) кустов черноплодной рябины старше 12–13 лет способствует увеличению урожайности в среднем на 10–20 %.
Плоды черноплодной рябины созревают более или менее одновременно — в последней декаде августа — конце сентября, поэтому их собирают в один срок. Ягоды, предназначенные для переработки, собирают без щитков, для хранения — со щитками, но так, чтобы не повредить кольчатки, расположенные у их основания. Для сушки плодов щитки развешивают на шпагате или проволоке в сарае или каком-либо другом помещении. Плоды, закладываемые на хранение, затаривают в ящики вместимостью 8 кг. При температуре до 10 °C плоды черноплодной рябины хорошо сохраняются в течение 2 мес.