Несмотря на явные симптомы серьезной болезни, появившейся уже вскоре после приезда из России, Гашек совершенно игнорировал врачей. До последних дней он сохранял свой неподражаемый юмор, стремился закончить «Похождения бравого солдата Швейка…». Как вспоминает Климент Штепанек, писавший последний год под диктовку Гашека его произведения, после окончания этого романа он собирался написать другой — «Похождения господина окружного начальника». Однако преждевременная смерть оборвала жизнь писателя 3 января 1923 года, когда ему не исполнилось еще и сорока лет.
На похороны писателя пришли почти все жители Липниц, много народа из окрестностей. Приезжих из Праги было немного. Проводил своего друга в последний путь художник Ладислав Панушка, который привез его в Липнице.
«Первого безбожника в Липницах хоронили без церковного обряда у кладбищенской ограды, вблизи пристанища самоубийц, где нам было милостиво разрешено выкопать Гашеку могилу», — пишет Климент Штепанек в своих воспоминаниях.
Никто, вероятно, в то время не понимал, что в захолустных Липницах рядом с самоубийцами был похоронен величайший чешский писатель, один из редких создателей художественного образа мирового значения, которому па века суждено быть спутником человечества. Только спустя три-четыре десятилетия это становится все более очевидным. Две даты 1963 года: 3 января — сорокалетие со дня смерти писателя и 30 апреля — восьмидесятилетие со дня рождения — послужили поводом для широкого, истинно всенародного чествования замечательного сатирика в Чехословакии и СССР; широко было отмечено в 1973 году пятидесятилетие его смерти и девяностолетие со дня рождения.