В 820 году н. э. арабский халиф Абдулла Аль Манум решил отыскать сокровища Хуфу. Тогда пирамида еще была покрыта облицовочными плитами из белого известняка. Под ним все входы в пирамиду были тщательно замаскированы.
Не в состоянии найти местоположение предполагаемой секретной двери в гробницу фараона, халиф приказал своим работникам начать рыть под пирамиду. Были пройдены десятки метров без всякого результата, и халиф уже хотел останавливать работы, но работники услышали глухое эхо тяжелого удара внутри пирамиды. Продолжая копать в направлении звука, они оказались в проходе, который вел вниз, вглубь пирамиды. На полу лежал большой каменный блок, который упал из потолка. Его и посчитали причиной шума. В начале коридора, который они обнаружили, была как раз та секретная дверь наружу, которую они пропустили.
Прокладывая путь вниз по коридору, они скоро оказались глубоко внизу, в естественной каменной породе ниже пирамиды. Коридор прекратил опускаться и шел горизонтально приблизительно 20 метров, затем закончился стеной.
Когда работники осмотрели упавший каменный блок, они обратили внимание на большой гранитный разъем выше него. Пройдя сквозь него, они обнаружили другой проход, который, расширяясь, шел прямо в центр пирамиды. Проследовав этим коридором, они обнаружили несколько гранитных блоков, закрывающих туннель. Они начинают рыть вокруг них вдоль стен и, наконец, оказываются в низком горизонтальном проходе, который ведет к небольшой квадратной пустой комнате. Эта комната впоследствии стала известна как «комната Королевы». Нет никаких сведений, подтверждающих, что она когда-нибудь выполняла эту функцию, однако название, как дань традиции считать пирамиды усыпальницами, по-прежнему живет.
Рабочие обратили внимание на открытое пространство в потолке на стыке двух коридоров. Поднявшись по нему, они оказались в так называемой «Большой Галерее», которая привела их к небольшому и низкому горизонтальному проходу. По нему они попали в большую комнату, около 11 метров длиной, 5 шириной и 6 высотой. Эту назвали «комнатой Фараона». В центре находился огромный гранитный «саркофаг» без крышки. На этом инвентарный список вещей исчерпывается — в остальном комната была полностью пустой.
Считается, что арабы, как будто желая отомстить за отсутствие сокровищ, попытались разобрать Большую пирамиду и отправить ее в качестве строительного материала в Каир, но после того как они сняли верхушку пирамиды, они оставили это утомительное занятие. Однако есть мнение, что верхушка пирамиды отсутствовала уже задолго до них.
В научной среде бытует убеждение, что пирамида, подобно многим другим захоронениям египетской знати, стала жертвой грабителей еще задолго до того, как в нее вошел Абдулла Аль Манум. Хотя, если верить свидетельствам его рабочих, гранитные камни, блокировавшие проходы, были все еще на месте, когда они вошли в могилу.
В 1638 году английский математик, Джон Грейвс, посещавший пирамиду, обнаружил узкий ход, скрытый в стене, который соединял Большую Галерею с нисходящим проходом. Оба конца его были плотно закрыты, а пол завален обломками. Некоторые археологи решили, что этот маршрут использовался последними из людей фараона, чтобы выйти из гробницы, после того как закрывающий камень будет установлен на место, и возможно, через этот проход грабители и вынесли сокровище. Но небольшой размер прохода и наличие обломков камней вызывали сомнения в том, что такое огромное количество сокровищ, включая крышку саркофага, могло быть украдено и вынесено именно этим путем.
Высказывались предположения, что пирамида никогда не использовалась в качестве гробницы, а была астрономической обсерваторией. Римский автор Прокл утверждает, что до окончания строительства пирамида использовалась именно в таком свойстве. Однако никаких подтверждающих эту версию находок тоже нет.
Другие пирамиды, как правило, совершенно не похожи на Великую ни по размерам, ни по внутреннему устройству. Однако по крайней мере часть из них действительно построена египтянами. Загадку представляет собой вообще возникновение культуры Древнего Египта. Как пишет один из египтологов, Джон Энтони Вест: «…каждая отрасль знания в Египте как будто с самого начала имела завершенный характер. В науке, изобразительном искусстве и строительной технике, в иероглифической системе — нигде не видно никаких признаков этапа развития; многие достижения первых династий так никогда и не были превзойдены…»