Обе стороны стали готовиться к надвигающемуся вооруженному столкновению. Мурзуфл понял опасность, исходившую от венецианских штурмовых трапов; чтобы избежать ее, он приказал возвести деревянные постройки на башнях приморской стены, добавив им в высоту два или три этажа, а также деревянные укрепления для не несущих наружных стен. На сухопутной стене император приказал заложить кирпичами многие ворота. И хотя крестоносцы пытались патрулировать вдоль сухопутной стены и мешать поступлению припасов, императору удалось ввести в город много дополнительных войск. Вооруженные отряды должны были собирать продовольствие для города, и сам император время от времени ездил вместе с фуражирами. Население Константинополя радовалось этой военной деятельности. На стороне крестоносцев возобновились прежние приготовления. И снова камнеметательные машины, установленные на кораблях и вблизи сухопутных стен, начали бомбардировать город с целью беспокоить и изнурять его защитников. Западноевропейцы считали это оружие очень эффективным и заметили, что у византийцев оно отсутствует. Тем временем венецианцы восстановили сходни на своих мачтах, подняв их выше, чем раньше, в то время как французские рыцари строили различные передвижные деревянные укрытия для оказания помощи при подрыве сухопутной стены.
Главное столкновение между двумя сторонами произошло из-за нехватки продовольствия у крестоносцев, конюхи которых опустошили окрестности на два дня пути вокруг. Зимняя погода сделала навигацию невозможной для подхода кораблей с целью снабжения, хотя венецианские галеры могли совершать налеты на оба берега пролива. Очевидно, в феврале 1204 г. Генрих Фландрский напал на город Филею, расположенный на побережье Черного моря, где взял огромное количество трофеев, особенно продовольствия. Пока он находился там, Мурзуфл узнал о его успехе и решил устроить засаду возвращавшемуся каравану. Тайно покинув столицу с большим войском в ночное время, он устроил ловушку. Французы попали в нее, но Мурзуфл ждал, пока подъедет Генрих и его арьергард, а затем нанес удар. Понимая, что бегство бесполезно, французы так отчаянно защищались, что византийцы испугались, как бы к ним из лагеря крестоносцев не подошло подкрепление. Через некоторое время императорское войско побежало, вынудив Мурзуфла бросить свое императорское знамя, часть экипировки и икону Богородицы, которую императоры, по обычаю, возили с собой перед сражением. Утрата этой иконы якобы уронила авторитет Алексея V в глазах горожан; но, несмотря на свое поражение, византийцы продолжали ежедневно совершать нападения на вражеских фуражиров и отдельных отставших солдат.
Перед финальным натиском крестоносцы определили свои военные цели. Перед ними была возможность повторения событий июня 1203 г.: если бы Мурзуфл бежал, византийцы могли бы найти какого-нибудь представителя рода Ангелов или Комнинов, притязания которого они не могли игнорировать. Они решили, что империю следует завоевать и отнестись к ней как к трофею, раздел которого был тщательно продуман: венецианцы должны были получить компенсацию за их расходы, а оставшаяся добыча, земля и должности должны были быть поделены по справедливости между всеми сторонами.
Когда приготовления были закончены, для штурма была выбрана пятница 9 апреля 1204 г. Французы со своей осадной техникой высадились на берегу неподалеку от Влахерн для нападения на сухопутную стену в том же самом месте, что и раньше. Ожидавшие такого хода византийцы собрали там батарею камнеметалок, которые бросали камни вниз на деревянные укрытия, предназначенные для защиты французских минеров. Большая часть этих щитов и укрытий была разбита, и французы были вынуждены отступить. Основная масса кораблей повела атаку на приморскую стену также у Влахернского квартала, но южный ветер отгонял корабли назад в гавань. Только одно судно должно было атаковать каждую башню, и византийского гарнизона оказалось достаточно, чтобы сдерживать их; защитникам помогала добавленная высота башен в виде деревянных надстроек. Потерпевшие поражение венецианцы пострадали больше, чем византийцы. Алексей V, наблюдавший за обоими направлениями обороны с вершины холма рядом с монастырем Христа Пантепопта, был рад своему успеху.