Для Исаака тот факт, что толпе не удалось повторить бойню, был крупной победой. Латиняне оказывали стойкое сопротивление, и императорские уполномоченные не позволили толпе расправиться с ними. Так ставленник народа Исаак освободился от своей полной зависимости от него. И хотя после этого бунты против латинян по-прежнему возникали, они никогда не были серьезными, и императору всегда удавалось контролировать толпу. Так, не принося в жертву своих верных сторонников среди населения Константинополя, Исаак добился поддержки латинян. В будущем он так и балансировал между этими двумя фракциями, оставаясь независимым и от тех и от других.
Исааку было суждено сразу же потерять одного из своих вновь обретенных приверженцев. Конрад Монферратский не принимал участия в недавних беспорядках, но после своей победы над Браной он начал ощущать свою непопулярность при дворе: многие придворные были друзьями и родственниками Враны и не испытывали теплых чувств к победившему его человеку; население было враждебно настроенным; император так и не удостоил Конрада синих котурнов – знака принадлежности к рангу кесаря. Когда из Палестины пришла весть о том, что войска Саладина быстро теснят крестоносцев к морю, Конрад решил покинуть империю и отправиться спасать Святую землю. Исаак уехал во Фракию, чтобы возобновить прерванную войну с валахами, и Конрад воспользовался случаем сделать тайные приготовления и нанять генуэзский корабль для путешествия в Сирию. Вместо того чтобы откликнуться на призывы Исаака принять участие в войне на Балканах, он ускользнул, бросив свою жену-византийку, и 13 или 14 июля 1187 г., едва спасшись от сарацин неподалеку от гавани Акры (современный морской израильский порт Акко. – Пер.), добрался до Тира – главного уцелевшего христианского порта. Он взял на себя командование гарнизоном, успешно провел оборону города и вскоре женился на наследнице царства (Феодорой Ангелиной он просто пренебрег), и до самой своей безвременной смерти он носил титул короля Иерусалимского. Таким образом, попытка Исаака Ангела укрепить свое положение и в Италии, и в Константинополе путем союза с родом Монферратских ничем не увенчалась. Помощь Конрада была очень эффективна при подавлении самых крупных мятежей против императора, и отсутствие его умелого руководства и латинских рыцарей вскоре стало болезненно сказываться.
Несмотря на свои победы над Браной и городской толпой, Исаак Ангел по-прежнему сталкивался с вызовами своей власти. И хотя придворные вельможи изначально оказывали ему молчаливую поддержку, он не дал им наград и прибыльных должностей, на которые, по их мнению, они имели право. Многие из них считали себя по праву рождения более подходящими кандидатурами для трона, чем Исаак, и поэтому племянник императора Андроника Исаак Комнин сбежал из тюрьмы и поспешил провозгласить себя императором в Святой Софии в надежде на то, что к нему примкнет народ. О своем плане он договорился заранее с Константином Татикиосом, у которого имелись пятьсот сторонников, спрятавшихся в городе. Татикиос стал жертвой предательства, а Исаак Комнин был схвачен, прежде чем кто-нибудь смог присоединиться к нему; он умер от пыток, а Татикиос был ослеплен. Некий обедневший отпрыск рода Комнинов предпринял попытку аналогичной узурпации власти и точно так же был ослеплен.
Ни один член семьи Комнинов не был свободен от подозрений в том, что он тайно жаждет взойти на трон. Андроник Комнин Бриенний – внук Анны Комнины – был обвинен, очевидно, после 1191 г. в заговоре с незаконнорожденным сыном Мануила I Алексеем с целью свержения Исаака. Андроник, который был отозван со своего поста правителя Фессалоник, вернулся в Константинополь, не подозревая ни о чем, и был ослеплен. Вскоре после этого его сын провозгласил себя императором в Святой Софии и подвергся такому же наказанию. Путь Исаака к трону был таким легким, что многие пытались им следовать.
В то время как Константинополь был местом, где предпочитали поднимать восстания Комнины, в Малой Азии происходили восстания, организованные крупными землевладельцами, планы которых на момент попытки Враны захватить власть были сорваны, но сами они не сломлены. Видимо, в 1188 г. Теодор Манкафа перетянул на свою сторону жителей Филадельфии – главной крепости византийской Анатолии и нескольких соседних городов. Он взял себе императорский титул и даже чеканил от своего имени серебряные монеты. Сначала Исаак отнесся к этому как к шутке, но в начале лета 1189 г. он лично возглавил поход против Теодора, который заперся в Филадельфии. В это время крестоносцы Фридриха Барбароссы вели наступление в Балканах, и у Исаака не было времени на продолжительную осаду. После нескольких схваток он заключил с Макафой соглашение, по которому узурпатор отказался от своих притязаний на трон и прислал заложников для гарантии своего хорошего поведения, но сохранял свой пост правителя Филадельфии. Исаак возвратился в Константинополь; его руки были временно развязаны.