Иностранцы, посетившие в то время царский дворец, отмечали его великолепное состоящие. В этом была заслуга царя Федора и Ирины, их предшественник Иван Грозный под конец жизни предпочитал жить в Александровой слободе и довел до запустения кремлевские палаты.
Все парадные залы были вновь красиво расписаны золотыми и серебряными красками, на полах лежали яркие восточные ковры, около стен стояли горки с золотой и серебряной посудой, с потолка свисали красивые канделябры со свечами. Новшеством стали потолочные плафоны с росписями. По инициативе Ирины у заморских купцов были куплены хрустальные зеркала (они стоили очень дорого), придававшие палатам необычный вид.
Дворец украсили и многочисленные настенные, напольные и кабинетные часы, которые обычно дарили иностранные гости. Например, австрийский посол Н. Варкоч преподнес Федору часы с изображением планет. Другой посол привез часы с фигурками людей, играющих каждый час на различных музыкальных инструментах. Имелись часы и для царского рабочего стола с ящичками для письменных принадлежностей. В Грановитой палате рядом с троном стояли часы на слонах. Они мелодично звенели каждый час.
Отапливали дворец множество печей круглой или квадратной формы, украшенных цветными изразцами. В верхние покои тепло поступало по специальным трубам. В спальных покоях стены были обиты разноцветным сукном. Окна в зимнее время закрывали специальными утепленными ставнями из зеленого, вишневого или разноцветного сукна. Для красоты во многие окна вставляли рамы с разноцветными стеклами, которые изготавливались в Новгороде.
Необычайное впечатление производили крыши дворца — над разными помещениями разной формы: шатровой, бочковой или скирдовой. Трубы были узорчатые из обливных изразцов. Украшением крыш служили также башни и башенки с вызолоченными орлами, единорогами, львами вместо флюгеров. Очень красивы были карнизы с каменной резьбой в виде птиц, зверей и сказочных существ.
Еще одним новшеством стали башенные часы. Их установили в деревянных шатрах над тремя воротами: Фроловскими, Ризположенскими и Водяными. Имелись часы и на служебных помещениях дворца. Придворные должны были знать точное время, ведь жизнь царствующей четы проходила по четкому распорядку.
В конце XVI века в Кремле появляются Набережные сады. Возможно, на их месте существовали когда-то огороды для выращивания овощей к царскому столу, но плодовых деревьев не было. Можно предположить, что именно по указанию Ирины здесь разбили настоящие сады с заморскими растениями: яблонями, грушами, сливами и т. д. В них было хорошо прогуливаться в летнюю жару, а весной любоваться буйным цветением деревьев. Благодаря заботам царицы они стали красивейшим местом Кремля. Более обширные царские сады располагались на другой стороне Москвы-реки, напротив Китай-города. Они имели не столько декоративное, сколько хозяйственное назначение.
Федор и Ирина были исключительно богомольными и благочестивыми людьми, вместе занимались церковным строительством. После успешной обороны Москвы от крымцев был основан Донской монастырь с каменным шатровым храмом внутри. На Арбате возведена церковь Николы Явленного. Супруги пожертвовали большие суммы на сооружение каменных храмов в Троице-Сергиевом монастыре (Успенский собор, схожий с Кремлевским) и Пафнутьевском Боровском.
В подарок любимой жене царь Федор построил красивый каменный храм в Вознесенском монастыре. Вызолоченные купола кремлевских соборов придавали всему ансамблю очень нарядный вид.
Однако далеко не вся знать была довольна добрыми отношениями между супругами и тем, что в управлении державой играют большую роль Годуновы. Особенно злобствовали князья Шуйские, считавшие себя самыми родовитыми людьми государства. Единственным поводом для смещения ненавистных Годуновых могло стать бесплодие Ирины.
На самом деле царица часто была беременна, но дети либо рождались недоношенными, либо погибали во время родов. Одной из причин этого могло стать отсутствие квалифицированной медицинской помощи. Обычно роды проходили в мыльне в присутствии повивальной бабки. При каких-либо осложнениях помощи ждать было неоткуда.
Осенью 1586 года князья Шуйские решили открыто выступить против Ирины и заставить царя Федора развестись с ней «чадородия ради». Им удалось привлечь на свою сторону митрополита Дионисия и московских купцов. Сообща написали челобитие и публично передали царю. Однако реакция всегда спокойного и доброжелательного Федора поразила всех. В гневе он повелел жестоко наказать тех, кто осмелился вмешаться в его семейные дела. Главные противники Ирины, А. И. и И. П. Шуйские, были отправлены в ссылку, где вскоре умерли по непонятным причинам. Дионисия лишили сана и сослали в Хутынский монастырь, купцам публично отсекли головы.