3 апреля 1538 года молодая женщина вдруг скончалась (Елене было только тридцать лет). Никакой явной болезни современники у нее не заметили, поэтому предположили, что ее отравили. Последующие события показали, что к смерти великой княгини приложили руку князья Шуйские. Ведь именно они стали временщиками при юном государе.
Вряд ли Елене дали быстродействующий яд, как, к примеру, первой жене Ивана III, Марии Борисовне. Это было бы слишком явным и опасным делом. Великая княгиня, видимо, чахла постепенно. В последний год жизни она страдала от какого-то непонятного недуга: испытывала слабость, головокружение, тошноту. Это заставляло ее часто отправляться в богомольные поездки по монастырям. Во время них она чувствовала себя много лучше, полагая, что ее спасают истовые молитвы у чудотворных икон и мощей. На самом деле великая княгиня покидала дворец, где, видимо, находился источник хворобы, и это улучшало ее здоровье. Но постоянно пребывать в разъездах она не могла и в конце концов умерла.
Современные исследователи предположили, что Елену Глинскую постепенно отравляли парами ртути. В ее останках этот ядовитый металл содержался в большом количестве, намного превышавшем норму.
Возможно, ртуть содержалась в каких-то мазях или косметике; в ту пору трудно было определить, ядовито то или иное снадобье или нет, особенно если его вредные свойства проявлялись не сразу. Точно можно сказать только одно: многие хотели смерти великой княгини, но больше всего — князья Шуйские.
Летописцы без всякого сожаления отмстили дату безвременной кончины Елены — во втором часу дня, без предварительной тяжелой болезни. В тот же день она была похоронена в Вознесенском монастыре рядом с другими великими княгинями.
Скорость, с которой состоялось погребение, просто удивляет. Всего за несколько часов организовали прощание с ее останками родственников и москвичей, отпевание в Успенском соборе, соорудили саркофаг и выкопали могилу. Возможно, виновники се смерти торопились скрыть следы своего злодеяния, боясь, что если они будут всем очевидны, то великий князь вместе с Оболенскими начнет расследование.
Летописцы отметили, что во время прощания с телом Елены Васильевны плакали и открыто выражали свою скорбь только юный Иван и князь Иван Овчина. Остальные строили печальные лица и втихаря спрашивали друг друга: кто же теперь будет править государством? Ответ появился через неделю.
Князья Шуйские сумели склонить на свою сторону Боярскую думу и организовали над И. Ф. Овчиной Телепневым и его сестрой Аграфеной Челядниной суд. Их обвинили в том, что они пытались отнять власть у юного государя и править за него. Несмотря на протесты Ивана, последние близкие ему люди были арестованы. Телепнева бросили в тюрьму и уморили голодом (очень популярная тогда казнь). Аграфену сослали в Каргополь и там постригли в монахини. Восьмилетний сирота-государь остался один на один с алчными и властолюбивыми временщиками.
Наступила пора боярского правления, при которой Иван оказался игрушкой в руках честолюбцев, стремившихся одержать верх друг над другом. Стало ли это благом для государства? Ответ может быть только отрицательным. Свары у престола ослабляли верховную власть. Бояре дружной толпой грабили государеву казну и народ. Личное обогащение становится главной целью для многих. Интересы государства были забыты. Хаос, междоусобицы и борьба за влияние на юного правителя — вот черты начавшегося пятилетнего периода.
Безвременную кончину Елены Глинской следует считать несчастьем для Русского государства. Конечно. за время ее правления было допущено много ошибок. Особенно поражают властолюбие и жестокая расправа с теми, кто хоть немного мог ущемить ее могущество. Но в этом повинна не только она. Многочисленные соглядатаи и доносчики умышленно разжигали тайные подозрения великой княгини, стравливали с близкими родственниками. И все ради получения наград и повышения по службе.
Елена, при всем ее уме и способностях, была всего лишь молодой и достаточно неопытной женщиной, оставшейся вдовой с маленькими детьми на руках. Боязнь за их жизнь и будущее заставляла ее быть жестокой. Она полагала, что только смерть врагов, мнимых или реальных, принесет ей спокойствие и упрочит положение.
Став правительницей, Елена решила, что имеет право на личное счастье, и приблизила к себе того, кто давно ей был дорог. Можно ли ее порицать за это? Русское общество осудило ее и обрекло на раннюю смерть. Вдове великого князя, по законам того времени, полагалось вести монашеский образ жизни и навсегда лишить себя земных радостей. Зато вдовцу-государю было дозволено все: и жениться по нескольку раз, и заводить любовниц, надежно скрывая это в недрах кремлевского дворца. Характерный пример в данном случае — Иван Грозный.