Понимание регуляции микроРНК особенно важно[7151] потому, что одна микроРНК может блокировать более тысячи различных мессенджерных РНК[7152]. Таким образом, одна микроРНК способна заглушить более тысячи различных генов. В моей аналогии со строительством одна простая инструкция может приостановить работу всех рабочих второго этажа, пока рабочие первого этажа не закончат строительство. Далее, есть регуляторы, которые регулируют работу регуляторов, другие некодирующие РНК, которые мешают микроРНК останавливать работу мессенджерных РНК[7153], но не будем об этом.
И только когда эта сложность показалась непомерной, исследователи поняли: хотя существует триллион возможных комбинаций микроРНК длиной в 20 букв, составленных из четырехбуквенного алфавита РНК, в человеческом организме, по-видимому, активны лишь несколько тысяч микроРНК[7154]. А в каждой конкретной клетке пять наиболее распространенных микроРНК составляют в среднем половину общего пула микроРНК в клетке[7155]. Однако в 2007 году все стало гораздо интереснее.
МикроРНК циркулируют по крайней мере в двенадцати различных биологических жидкостях человека[7156]. (Когда я это прочитал, мне пришлось остановиться и подумать: «Подождите. Могу ли я назвать хотя бы дюжину биологических жидкостей?») Мы не думали, что такое возможно, поскольку у нас есть ферменты, которые измельчают любую плавающую РНК вне наших клеток (в качестве меры предосторожности против вирусов, которые часто приходят с РНК). Оказалось, что РНК переносится в экзосомах – крошечных пузырьках, которые отщепляются от клеток. Раньше мы думали, что эти пузырьки – всего лишь устройство для утилизации отходов клеток[7157]. (Почему ученые, когда чего-то не понимают, сразу называют это мусором?) Но в 2007 году мы обнаружили, что экзосомы наполнены микроРНК[7158]. Так наши клетки общались друг с другом! Таким образом, клетка печени может посылать микроРНК для регулирования генов в клетке легкого, а она затем может регулировать клетку мозга, или наоборот. Они даже способны общаться со следующим поколением, передавая свой груз микроРНК в сперматозоид или яйцеклетку[7159].
Каков же итог всего этого? Теперь можно с уверенностью сказать, что микроРНК, вероятно, регулируют практически все биологические процессы, влияя на все аспекты здоровья[7160]. Мыши, генетически сконструированные таким образом, что они не способны вырабатывать микроРНК, даже не проходят стадию эмбриона[7161]. Заболевания всех форм и размеров были вызваны дисрегуляцией микроРНК[7162]. Но есть и хорошая новость: с этим можно что-то сделать. Экспрессию микроРНК можно изменить с помощью диеты[7163].
Какое отношение это имеет к старению? МикроРНК являются одним из основных регуляторов всех клеточных путей[7164], и эта связь имеет особое значение. Самая первая микроРНК была обнаружена у скромного круглого червя C. elegans[7165]. Угадайте, что она делала? Она регулировала продолжительность жизни. Снижение активности простой микроРНК сокращает продолжительность жизни и ускоряет старение тканей, тогда как ее сверхэкспрессия значительно продлевает жизнь. Оказалось, что мишенью микроРНК является ген-супрессор DAF-16[7166]. DAF-16 – это аналог гена FOXO у червей, который может обеспечивать бессмертие некоторым примитивным животным[7167]и является одной из важнейших генетических детерминант экстремального долголетия у человека[7168]. Блокируя репрессию этого гена долголетия, микроРНК оказывала эффект продления жизни. Зная характер экспрессии всего нескольких микроРНК у C. elegans, можно эффективно прогнозировать продолжительность жизни отдельных животных[7169].
Для изучения влияния микроРНК на продолжительность жизни млекопитающих была проведена серия экспериментов на мышах по изменению образа жизни. Одну группу мышей посадили на диету с высоким содержанием жиров, и они прожили 101 неделю. Вторая группа была переведена на высокожировую диету с добавлением добровольных физических упражнений и прожила 114 недель. Следующая группа получала низкожировое питание, что позволило им прожить до 127 недель. Четвертая группа была переведена на низкокалорийную диету плюс физические упражнения и прожила 131 неделю. Пятой группе ограничивали калорийность рациона, но содержание жиров было высоким – она прожила 137 недель. И наконец, мыши, которых перевели на низкокалорийную диету, прожили 153 недели, то есть более чем на 50 % дольше, чем мыши из первой группы с высоким содержанием жиров. Используя этот подход, исследователи обнаружили, что 92 микроРНК коррелируют с продолжительностью жизни, в том числе восемьдесят четыре – обратным образом. Другими словами, микроРНК в целом подавляли гены долголетия, так что уровень некоторых микроРНК был до 90 % ниже в группе самых долгоживущих[7170]. Однако есть и исключения.
7151
Tarallo S, Pardini B, Mancuso G, et al. MicroRNA expression in relation to different dietary habits: a comparison in stool and plasma samples. Mutagenesis. 2014;29(5):385–91. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25150024/
7152
Majidinia M, Karimian A, Alemi F, Yousefi B, Safa A. Targeting miRNAs by polyphenols: novel therapeutic strategy for aging. Biochem Pharmacol. 2020;173:113688. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31682793/
7153
McNeill EM, Hirschi KD. Roles of regulatory RNAs in nutritional control. Annu Rev Nutr. 2020;40:77–104. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32966184/
7154
Cong L, Zhao Y, Pogue AI, Lukiw WJ. Role of microRNA (miRNA) and viroids in lethal diseases of plants and animals. Potential contribution to human neurodegenerative disorders. Biochemistry Moscow. 2018;83(9):1018–29. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30472940/
7155
McNeill EM, Hirschi KD. Roles of regulatory RNAs in nutritional control. Annu Rev Nutr. 2020;40:77–104. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32966184/
7156
Weber JA, Baxter DH, Zhang S, et al. The microRNA spectrum in 12 body fluids. Clin Chem. 2010;56(11):1733–41. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20847327/
7157
Alshehri B. Plant-derived xenomiRs and cancer: cross-kingdom gene regulation. Saudi J Biol Sci. 2021;28(4):2408–22. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33911956/
7158
Valadi H, Ekström K, Bossios A, Sjöstrand M, Lee JJ, Lötvall JO. Exosome-mediated transfer of mRNAs and microRNAs is a novel mechanism of genetic exchange between cells. Nat Cell Biol. 2007;9(6):654–9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17486113/
7159
Cammarata G, Duro G, Chiara TD, Curto AL, Taverna S, Candore G. Circulating miRNAs in successful and unsuccessful aging. A mini-review. Curr Pharm Des. 2019;25(39):4150–3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31742494/
7160
Wang L, Sadri M, Giraud D, Zempleni J. RNase H2-dependent polymerase chain reaction and elimination of confounders in sample collection, storage, and analysis strengthen evidence that microRNAs in bovine milk are bioavailable in humans. J Nutr. 2018;148(1):153–9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29378054/
7161
Bernstein E, Kim SY, Carmell MA, et al. Dicer is essential for mouse development. Nat Genet. 2003;35(3):215–7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14528307/
7162
Kalarikkal SP, Sundaram GM. Inter-kingdom regulation of human transcriptome by dietary microRNAs: emerging bioactives from edible plants to treat human diseases? Trends Food Sci Technol. 2021;118:723–34. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0924224421005999
7163
Cammarata G, Duro G, Chiara TD, Curto AL, Taverna S, Candore G. Circulating miRNAs in successful and unsuccessful aging. A mini-review. Curr Pharm Des. 2019;25(39):4150–3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31742494/
7164
Majidinia M, Mir SM, Mirza-Aghazadeh-Attari M, et al. MicroRNAs, DNA damage response and ageing. Biogerontology. 2020;21(3):275–91. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32067137/
7165
Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell. 1993;75(5):843–54. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8252621/
7166
Boehm M, Slack F. A developmental timing microRNA and its target regulate life span in C. elegans. Science. 2005;310(5756):1954–7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16373574/
7167
Morris BJ, Willcox DC, Donlon TA, Willcox BJ. BFOXO3: a major gene for human longevity – a mini-review. Gerontology. 2015;61(6):515–25. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25832544/
7168
Calissi G, Lam EWF, Link W. Therapeutic strategies targeting FOXO transcription factors. Nat Rev Drug Discov. 2021;20(1):21–38. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33173189/
7169
Pincus Z, Smith-Vikos T, Slack FJ. MicroRNA predictors of longevity in Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 2011;7(9):e1002306. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21980307/
7170
Green CD, Huang Y, Dou X, Yang L, Liu Y, Han JDJ. Impact of dietary interventions on noncoding RNA networks and mRNAs encoding chromatin-related factors. Cell Rep. 2017;18(12):2957–68. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28329687/