К тому времени, как была завершена работа над трилогией о звездных войнах, Джонстон стал не только ведущим специалистом в «Industrial Light & Magic», но и совладельцем этой фирмы. Джордж Лукас умеет ценить своих помощников. А Джо Джонстон стал фигурой в киномире весьма уважаемой. Лишнее свидетельство тому — «Оскар», полученный им за работу над «Искателями потерянного ковчега» — первым фильмом об Индиане Джонсе. И только Джонстону удалось убедить своего босса спустя несколько лет вернуться к теме «Звездных войн». А поскольку сам Лукас наотрез отказывался снимать или продюсировать новые серии, то Джонстон предложил сделать что-нибудь для телевидения. В результате появились сразу два полнометражных телефильма — «Приключение эвоков» (1984) и «Эвоки: битва за Эндорру» (1985) все с теми же мохнатыми «взрослыми детьми» в главных ролях. Излишне говорить, кто был художником-постановщиком в «Эвоках». Впрочем, сам Джонстон не считает этот опыт особо удачным: «В то время никто не верил. что можно снимать по-настоящему зрелищные телефильмы. Нам все время говорили: этот трюк лишний, у нас нет на него денег. И тем не менее постоянно снимали мои игрушки крупным планом!» А поскольку делали «Эвоков» режиссеры молодые, то они постоянно обращались к Джо за советом. «В конце концов мне это надоело, и я сказал Джорджу: «Я сам могу снять лучше!».
Нахальное заявление удачливого компьютерщика не осталось незамеченным. И вскоре (в 1988 году) ему представилась возможность подтвердить свои режиссерские амбиции. Разумеется, продюсеры без энтузиазма отнеслись к идее доверить режиссеру-дебютанту сколько-нибудь солидный бюджет. Помог все тот же Джордж Лукас. Он подписал специальный контракт, по которому обязался практически бесплатно перемонтировать фильм и доснять нужные эпизоды в том случае, если представленная Джонстоном версия будет признана неудовлетворительной. Но к помощи мэтра прибегать не пришлось — бывший программист и художник прекрасно справился сам. Он снял веселую фантастическую комедию «Дорогая, я уменьшил детей», которая неожиданно для всех стала в 1989 году одним из чемпионов проката, собрав 130.7 миллиона долларов (больше, чем вторые серии «Назад в будущее» или «Охотников за привидениями»), Уж больно понравилась публике история о чудаковатом профессоре Уэйне Сзалински, который изобрел «электромагнитный уменьшитель» и случайно испытал его на четверых детях. Приключения маленьких американцев в стране гигантских муравьев, скорпионов и чипсов произвели на зрителей неизгладимое впечатление. Собственно, успех картине принесли именно виртуозные спецэффекты, хотя все критики дружно отметили удивительную бредовость сюжета и диалогов. Джонстон же доказал, что может сделать хит даже из столь непритязательного материала. Попутно заметим, что в «Дорогая, я уменьшил детей» проявилась и еще одна особенность Джонстона-режиссера — его пристрастие не просто к фантастике, но к фантастике светлой и доброй. «Я сам испугался, когда увидел увеличенное изображение муравья, и сказал помощникам — надо его переделать. Мы уменьшили ему челюсти, увеличили глаза и получилось вполне доброжелательное насекомое. Когда мне говорят, что таких муравьев не бывает, я отвечаю, что снимал семейный фильм, а не ужастик про насекомых», — пояснял режиссер.
Уверившись в собственных силах, Джонстон решил попробовать себя и в иной стилистике, от семейного кино достаточно далекой. Он отказался от работы над продолжением своей дебютной картины («Дорогая, я увеличил ребенка») и в 1991 году взялся за съемки фильма по мотивам некогда популярного телесериала «Ракетчик». При этом история о герое-летчике времен второй мировой, который умел летать лучше, чем Карлсон (поскольку носил на спине ранец с ракетным двигателем), приобрела в киноверсии несколько своеобразный оттенок. Здесь Джонстон обильно цитировал фильмы об Индиане Джонсе и Джеймсе Бонде, внеся в простодушный сюжет изрядную долю здоровой иронии. Результат был неожиданным. На сей раз в восторге оказались кинокритики, окрестившие «Ракетчика» «постмодернистским комиксом». Зато зрители отнеслись к фильму весьма прохладно. «Впервые я столкнулся с тем, что фильм нравится мне и не по вкусу публике. Хотя мне казалось, что я сделал свою работу не хуже, чем тот же Земекис. Я был очень разочарован. Но «Ракетчик» до сих пор мой любимый фильм», — признается Джо сейчас.
Так или иначе, а огорченный Джонстон вернулся к семейному кино. Но от пристрастия к фантастическим поворотам сюжета и ярким спецэффектам не отказался. И потому его следующим фильмом стал «Повелитель страниц» (1994). На сей раз ему в руки попал сценарий о приключениях мальчика, заснувшего в библиотеке. «Я сразу сказал: мы будем делать смешанную картину — наполовину игровую, наполовину мультфильм, — вспоминает Джонстон. — Но выяснилось, что на нового «Кролика Роджера» денег не хватает, и пришлось сделать эти части раздельно». За мультипликацию отвечал известный аниматор Морис Хант, но общее руководство оставалось за Джонстоном. И Джо развернулся: он настоял на внесении в сценарий нескольких дополнительных эпизодов и персонажей. Получилась увлекательная фантастическая сказка о ребенке (его сыграл Маколей Калкин), который путешествует по страницам и сюжетам книг, сталкиваясь то с Моби Диком, то с Джекилом и Хайдом, то с воплощенным Ужасом.
Сказки сказками, но Джо не забывал и о своем наставнике Джордже Лукасе. И когда Лукас со Спилбергом решили продюсировать телесериал «Хроники молодого Индианы Джонса», одну из серий («Принстон») поставил Джонстон. Однако бывшему программисту хотелось большего. В 1995 году он получил прекрасную возможность показать все, на что способен, и не подкачал, сняв «Джуманджи» (1995) — свой второй фильм, который собрал в прокате более 100 миллионов долларов. Пожалуй, эта картина Джонстона лучше всего известна нашим читателям (она была даже в российском кинопрокате). Сюжет ее (как и полагается в семейном фильме) незатейлив и основан на одном фантастическом допуске: существует некая игра, которая становится реальностью. Она называется «Джуманджи» и может затащить человека в джунгли на двадцать лет или превратить мальчика в обезьянку. Игра превращает жизнь тихого американского городка в настоящий кошмар, когда на его улицы вырываются стада слонов и бегемотов.
Она, наконец, предоставляет главному герою еще один шанс: он может вернуться в свое детство и прожить жизнь заново, не причиняя зла окружающим.
Такие навороты позволили Джонстону проявить свои технократические таланты во всей красе: «Джуманджи» стал рекордсменом по объему использованной компьютерной графики. «Мы добились большего, чем в «Парке юрского периода», — утверждает режиссер. — В конце концов сделать реалистичного динозавра легко, — все равно никто не знает, как он должен выглядеть. А вот каков лев, знают все. К тому же у льва есть шерсть, и она все время в движении. Нам пришлось все это моделировать. Не могли же мы живого льва гонять за живыми носорогами по Лос-Анджелесу!». Зрители поверили компьютерным моделям, которые подчиненные Джонстона создавали на студии «Industrial Light & Magic». А Джонстон снова подтвердил свою репутацию современного сказочника, которому нужен компьютер, чтобы рассказать простую историю.