Поздней осенью 1539 г. Тургут не ушёл с флотом Хайреддина на зимовку, а решил поохотиться за торговыми судами в Зап. Средиземноморье в нетрадиционный для корсаров сезон. Император Священной Римской империи велел поймать морских разбойников. Джансттино Дориа с эскадрой из 10 галер отправился в Мессину, чтобы гам соединиться с командующим галерами Сицилии и идти к берегам Сардинии и Корсики. В конце мая 1540 г. христианская эскадра снялась с якорей, а уже в июне Тургут был захвачен христианами у берегов Корсики и стал гребцом на собственной галере. Через несколько лет генуэзцы потребовали за его освобождение 3 тыс. крон и о. Табарку, и Хайрсдтин согласился выполнить это требование. В 1544 г. Тургут вернулся в Тунис и возобновил свои рейды.
В 1546 г., после смерти Хайреддина, Тургут атаковал берега Сицилии, Сардинии и Апеннинского п-ва. В том же году его корабли опустошили о. Гоцо, в 1547 г. высадили десант на Мальте, а в 1548-м — захватили казну Мальтийского ордена, взяв на абордаж галеру, перевозившую доходы рыцарей от их итальянских владений. В том же году Тургут прибыл в город Тунис и подарил султану Мулаю Хамиду часть своей добычи, включая красавицу-итальянку, похищенную в городе Кастелламаре. В 1549 г. он подавил восстание в Махдии, превратив эту крепость в одну из своих баз. В июне следующего года итало-испанский флот под командованием Андреа Дориа атаковал Махдию. Тургут потерпел поражение и отступил на Джербу. Зиму 1550—1551 гг. его флотилия из 3 галер и 15 галиотов провела в укромной бухточке близ залива Эль-Кантара на восточной оконечности острова. Гавань была неприступна. Вход в бухту контролировался фортом, пушки которого держали под обстрелом фарватер. Андреа Дориа, хорошо знавший секреты Джербы, решил захватить Тургута врасплох. Весной 1551 г. он отправился из Генуи в Махдию с 11 галерами, объединился по пути с галерами вице-короля Сицилии и 12 апреля подошёл к Джербе, блокировав флотилию Тургута в упомянутой бухте. Чтобы вырваться из западни, корсар придумал хитрый план. Отвлекая внимание Дории фортификационными работами в районе форта, Тургут при помощи местных жителей прорыл канал из бухты на запад, к Аджиму, и через восемь суток проволок свои суда к морю. Можно представить себе изумление Дориа, когда он узнал, что идущие ему на подмогу галеры из Италии были атакованы в открытом море пиратами Тургута. Два судна стали их добычей.
Укрывшись на юге Туниса, Тургут вскоре предпринял неудачный поход на Гафсу, а затем с 18 судами укрылся в устье Уэд-Габеса. В этой ситуации турецкий султан Сулейман I оказал ему военную поддержку, назначив командующим адриатическим дивизионом османского флота.
В июле 1551 г. турецкая армада, состоявшая из 112 галер и множества вспомогательных судов, появилась у берегов Мальты. Ею командовали Юсуф Синан, Тургут Рейс и Салах Рейс. Высадившийся на острове десант попытался овладеть мальтийской цитаделью, но упорное сопротивление рыцарей заставило турок отступить. В отместку они разграбили о. Гоцо и увели в рабство 5 тыс. его жителей. В начале августа турецкий флот появился у города Триполи. Местным гарнизоном командовал Гаспар де Валье. В его распоряжении было 300 мальтийских рыцарей, 100 арабских аскеров и 600 итальянских наёмников. Де Валье отверг ультиматум турок, и 8 августа те начали обстрел Триполи. Итальянские наёмники не хотели сражаться и взбунтовались. 14 августа при посредничестве французского посла де Валье вынужден был сдать город. Ок. 200 уцелевших рыцарей были эвакуированы на французских судах; итальянцев турки отправили в Стамбул, мавров-аскеров как предателей разорвали на куски.
В 1552 г. Тургут совершил нападение на Неаполь, а в начале 1553 г. был назначен капудан-пашои османского флота. В феврале султан заключил союз с французским королём Генрихом II.
Летом флот Тургута объединился с французской эскадрой и отправился к берегам Корсики, принадлежавшей в то время Генуе. Флот высадил на острове французские войска, но в это время Тургут рассорился с союзниками и в декабре привёл свои корабли в Стамбул.
Кампания 1554 г. оказалась ещё менее результативной. Боевые операции проводились вяло, и французы предположили, что Тургут подкуплен испанцами. Репутация его оказалась подмоченной, и он бесславно вернулся в Стамбул. В отличие от Хайреддина, ему не удалось приспособиться к придворной жизни, и в 1556 г. султан назначил его бейлербеем Зап. Триполи. Осенью того же года Тургут захватил Гафсу, а затем взял под контроль Джербу. В 1560 г. испанцы снарядили экспедицию под командованием дона Хуана де ла Серды, герцога Медина-Ссли, и отправили её на завоевание Джербы. 2 марта испанский флот в составе 90 кораблей подошёл к острову, а 7 марта на берег были высажены 14 тыс. человек. Спустя несколько дней войска герцога овладели главной крепостью. Тургут попросил помощи у турецкого султана. 11 мая 85 турецких кораблей под командованием Пияле-паши подошли к Джербе. Испанский флот, уклонившись от боя, начал уходить на север. Но 14 мая в Керкеннском проливе турки разгромили его: из 90 кораблей было потоплено и сожжено 20 галер и 27 транспортов, 21 галера и 12 более мелких судов были захвачены. 16 мая Тургут высадился на Джербе с 5-тысячным отрядом; Пияле-паша добавил к этому 2 тыс. янычар, 3 тыс. спахиев и 2 тыс. матросов. К концу мая к ним прибыло подкрепление из Триполи. 31 июля крепость пала. По приказу Тургута все пленные были казнены, а из отрубленных голов сложена гигантская пирамида — Башня из черепов, которая стояла на Джербе до 1846 г.