Религия пронизывала все сферы жизни минойцев. Насколько позволяют судить археологические находки, главным объектом религиозного поклонения была великая богиня — мать-прародительница, владычица, божество плодородия. Известна она и в грозном обличье Горгоны с волосами в виде извивающихся змей. Но главным воплощением разрушительных сил природы — землетрясений, штормов, цунами, представлявших большую и часто напоминавшую о себе опасность для жителей Крита, — вероятно, было мужское божество, воплощавшееся в образе могучего и свирепого быка. Отражением его культа служат знаменитая фреска игры с быком и другие изображения и архитектурные детали. На некоторых минойских печатях бог-бык изображен в виде человека с бычьей головой, что вызывает в памяти древнегреческий миф о Минотавре.
Голова медузы из храме Эскулана II вей до н.э.
Своеобразным отражением рассматриваемого события может быть древнегреческий миф о Девкалионовом потопе, известный по источникам V века до новой эры.
Миф рассказывает, что Зевс решил истребить людей бронзового века движением гор и сильным ливнем, затопившим большую часть Греции. Но Девкалион, предупрежденный своим отцом Прометеем, построил ковчег, в котором с женой Пиррой плавал 9 дней, пока не пристал к высокой горе (Парнасу или Отрису в Фессалии). Согласно Паросской хронике 265 года до новой эры, это событие имело место в 1530 году до новой эры, что совпадает с "низкой" датой Великого Минойского извержения и предварившего его сильнейшего землетрясения. Поэтому можно допустить, что миф о потопе, получивший наибольшее распространение в Аттике, то есть на эгейском побережье Греции, навеян цунами от землетрясения-извержения или сильным ливнем, вызванным извержением.
На юге острова Санторин, возле современного селения Акротири, были обнаружены остатки города минойского времени, погребенного продуктами Великого Минойского извержения. Погребенный город был построен на руинах среднеминойского города и датируется началом позднеминойского периода. Катастрофа застала город в пору его расцвета. Извержению предшествовало сильное землетрясение, разрушившее город.
Следы Великого Минойского извержения и землетрясения обнаружены в ряде мест Эгейского региона. В развалинах Кносского дворца на Крите найдены пеплы, сопоставляющиеся по времени и химическому составу с рассматриваемым событием. Последствия землетрясения были столь серьезными, что их не удаюсь полностью ликвидировать в течение всей эпохи, вплоть до нового разрушения дворца при вторжении ахейцев на Крит примерно в середине XV века.
Следы сейсмогенного разрушения. пепел и куски пемзы обнаружены в разных частях Крита (поселении Пицидия, Нироу Хани, Като Закрое, Палаикастро и вилле Амнисос) и на близлежащих островах Мочлос (у восточной оконечности Крита) и Псейра (у его северо-восточной оконечности). Они частично попали туда, возможно, в результате цунами, возбужденного вулканическим взрывом. На турецком побережье обнаружены следы морской транспортировки пемзы, а в озерах Западной Турции найдены прослои пепла мощностью 9 — 12 см. возможно, также связанные с этим извержением.
Интересные данные получены при раскопках городов Сераглио на Косе и Трианда на Родосе. Оба города, как и Акрстири, наследовали более ранние поселения бронзового века и были крупнее их. В обоих поселениях выделяются две фазы, между которыми было сильное землетрясение, разрушившее город. Восстановление не было закончено, когда случилось второе сильное землетрясение, и сразу вслед за ним руины были покрыты слоем пепла. Мощность пепла —10 — 20 см, в Трианде — до 70 см, а южнее города — до 40 — 90 см. Значительная часть прежнего города так и осталась невосстановленной и покрытой пеплом. Рядом обнаружено большое кладбище того же времени, где захоронения лишены традиционных украшений и других ритуальных принадлежностей. Вероятно, здесь были захоронены жертвы этой катастрофы.