Когда в Москве началось строительство жилых массивов на свободных городских землях, Ашот Ашотович вошел в число первых мастеров архитектуры, включившихся в решение этой повой градостроительной проблемы, приняв участие в разработке проекта планировки и застройки жилого района Хорошево-Мневники.
В творчестве любого мастера бывают этапы особого подъема, целеустремленности исканий, когда в одном произведении воплощается опыт, накопленный на протяжении всего жизненного пути. Такими стали для Мндоянца дни проектирования и строительства Кремлевского Дворца съездов. В числе авторов проекта Ашот Ашотович был удостоен Ленинской премии 1962 г. Дворец создавался в период большой творческой перестройки нашей архитектуры, и, по сути дела, ему принадлежит важнейшая роль в определении стилевой направленности советского зодчества. В его проекте смело и мастерски разрешены трудные, во многом новаторские задачи. Здесь удалось не только разработать качественно новый тип общественного здания, но и добиться, чтобы Дворец стал органичной частью его исторического окружения и сочетал в себе черты современной архитектуры с великими традициями русского зодчества. Удачно определив масштаб и композицию здания, авторы с большим художественным тактом вписали его в живописную панораму Кремля. Не подражая историческим стилям, они ответили на поставленную задачу целиком в духе творческих устремлений нашего времени и создали произведение, не только отвечающее практическим целям, по и выражающее в своем художественном образе передовые идеи эпохи.
В начале 1960-х гг. Мндоянц приступил к таким значительным градостроительным работам, как застройка проспекта Калинина и курорта Пицунда. Для своего времени каждая из них была новаторской. Строительство проспекта Калинина — первое после войны значительное преобразование обширного района в пределах Садового кольца — ознаменовало переход к принципиально новому этапу реконструкции столицы, основанному на формировании крупных ансамблей на главных направлениях развития общегородского центра. Курорт Пицунда — первый отечественный опыт единовременного строительства курортного комплекса, задуманного как целостный архитектурный организм.
Проспект Калинина вместе с Кутузовским проспектом образует один из основных радиальных лучей, ведущих от центрального ядра столицы — Кремля к ее западным подступам. Велико значение проспекта Калинина и как общегородского делового и общественно-торгового центра, притягивающего к себе людские массы. Создание этой магистрали определило крупный масштаб в застройке центральной части города и повлияло на формирование его современного архитектурного облика.
Правая и левая стороны проспекта контрастны по своему объемно-пространственному решению. В то же время здания каждой из сторон запроектированы в едином архитектурном ключе и композиционно дополняют друг друга. Скомпонованная как единое градостроительное целое, застройка проспекта представляет собой пространственно развитую ритмическую систему зданий, открывающихся перед зрителем по мере его движения вдоль магистрали в непрерывной смене ракурсов, образующих несхожие перспективы.
В этот многоплановый, развивающийся во времени ансамбль органично вошел комплекс зданий СЭВ, построенный по проекту архитекторов М. В. Посохина, А. А. Мндоянца, В. А. Свирского, инженеров Ю. В. Рацкевича, С. Я. Школьникова (1963—1970 гг.). Воздвигнутый в одной из ответственных точек города, у выхода проспекта к Москве-реке, он широко распахнутыми изогнутыми крыльями встречает въезжающих в центральную часть столицы. Комплекс отличается ясной организацией плана, логичностью общего объемнопространственного построения. Устремленные ввысь мощные крылья, распластанный стилобат, цилиндрический объем конференц-зала и, наконец, напряженная спираль подъездной эстакады предстают перед зрителем в различных сочетаниях в богатой смене ракурсов. Контрастируя и одновременно пластически дополняя друг друга, они формируют архитектурный ансамбль, который производит цельное, гармоничное впечатление.
Последней работой Ашота Ашотовича был павильон СССР на «ЭКСПО-67» в Канаде, спроектированный совместно с архитекторами М. В. Посохиным и Б. И. Тхором, инженером А. Н. Кондратьевым. Решая эту архитектурную задачу, авторы не пошли по пути создания аллегорий или символов, а попытались выразить идейное содержание сооружения своеобразным сочетанием ясности и гармонической уравновешенности с динамической напряженностью и устремленностью всей композиции здания ввысь. Ашот Ашотович выезжал в Монреаль на строительство павильона, но увидеть свое творение завершенным ему уже не довелось. Павильон был разобран, доставлен в Москву и смонтирован у Северного входа на территории ВДНХ.